国际研究参考

农作物论文_宁夏枸杞花药转录组分析及花药发育

 

文章摘要:目的为了探知宁夏枸杞Lyciumbarbarum花药发育过程及挖掘花药发育相关基因。方法以单双核花粉时期和成熟花粉时期的花药为研究材料,通过高通量IlluminaHiSeq2500测序平台进行转录组分析。结果组装共获得128,151条Unigene,将Unigene与NR、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、KEGG数据库比对,共有40,140条得到注释。在FDR(FalseDiscoveryRate)<0.05且差异倍数FC(FoldChange)≥2的条件下,单双核花粉时期与成熟花粉时期的差异表达基因共有46个。KEGG注释发现有4个差异表达基因参与甘油酯代谢、亚油酸代谢、苯丙氨酸代谢和苯丙烷类生物合成四个途径中。富含亮氨酸重复蛋白(LRR)、细胞周期蛋白(Cyclin)、类受体蛋白激酶(RPK)、E3泛素蛋白连接酶(MBR1)等11个差异表达基因参与了花药发育过程。随机选取其中5个差异表达基因进行qRT-PCR验证,表达结果与转录组数据基本一致,表明其数据真实可靠。结论 本研究为进一步解释宁夏枸杞花药发育的相关分子机制奠定了基础,也为后续研究宁夏枸杞花药发育的生物学特征提供了有益的基因资源。

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